La phylogénie moléculaire

S’approprier par la pratique des informations claires sur les différentes techniques de base utilisées en phylogénie moléculaire.

Se familiariser avec les ressources et les outils couramment utilisés en bio-informatique (NCBI, Blast, Serial Cloner, Seaview, BEAST).

ENSEIGNEMENTS

Notions Théoriques

– Structure du génome

– Structure des nucléotides

Notions de Bioinformatique

– Introduction à l’analyse phylogénétique

TRAVAUX DIRIGÉS

– La phylogénie (plus spécifiquement la phylogénie moléculaire)

– Construction et réalisation d’arbre phylogénétique

PARTIE PRATIQUE – TP

Travaux pratiques de bioinformatique

– Recherche d’information et ressources dans les banques

– Etudes et alignement de séquences

– Modèles d’évolution, modèles d’arbres

– Méthodes de distances et de parcimonie

– Méthodes de maximum de vraisemblance

– Phylogénie BAYESIENNE (logiciel BEAST)

– Lecture d’arbres